Embora pequenas porções possam ficar fora da geladeira por um curto período de tempo, a manteiga deve ter seu armazenamento principal na refrigeração. O ideal é mantê-la bem embalada ou em um pote hermético, que protege do ar, da luz e evita que absorva odores de outros alimentos.
Na geladeira, o lugar mais adequado é a parte interna, ou nas prateleiras próprias para laticínios, quando a geladeira oferece esse compartimento, onde a temperatura se mantém mais estável. A porta deve ser evitada, já que sofre variações constantes ao abrir e fechar.
Quando armazenada corretamente na geladeira, a manteiga dura, em média, até três meses, mantendo sabor, aroma e cor inalterados. A versão com sal costuma durar um pouco mais, enquanto a sem sal é mais sensível e deve ser consumida mais rapidamente.
A manteiga também pode ser congelada. Ela pode ficar no freezer por até três meses sem alterar textura ou sabor. O ideal é embalá-la em porções menores, em pote hermético ou envolvida em plástico, para evitar o contato com ar e odores. Para usar, basta descongelar a quantidade necessária na geladeira.