Normalmente não é necessário realizar tratamento específico para a varíola dos macacos, já que os sintomas da doença costumam desaparecer após algumas semanas. No entanto, em alguns casos, o médico pode indicar o uso de medicamentos para aliviar os sintomas mais rapidamente.
É importante que na presença de sinais e sintomas indicativos de varíola dos macacos, a pessoa vá ao hospital para que seja monitorada e para prevenir a transmissão da infecção, apesar de ser raro.
Além disso, em alguns casos, pode ser indicado o uso de medicamentos que foram aprovados para o tratamento da varíola "comum", como o Tecovirimat e o Brincidofovir. No entanto, como esses medicamentos não foram testados em pessoas doentes, o uso desses medicamentos é apenas indicado quando existem vários casos, servindo para prevenir e controlar a disseminação da doença.