O eixo intestino-cérebro conecta a microbiota ao cérebro por meio de redes intestinais complexas. Receptores no intestino, células enteroendócrinas, sistema nervoso entérico e o nervo vago atuam em conjunto para modular funções vitais como imunidade, metabolismo e sono. Essa comunicação bidirecional afeta diretamente o comportamento e o equilíbrio interno do corpo.
Ao longo da vida, as alterações no microbioma também acompanham o desenvolvimento e o envelhecimento cerebrais. Isso indica que nossa microbiota evolui junto com o cérebro e pode influenciar o risco de doenças ao longo dos anos.