É sempre recomendado fazer download de aplicativos nas lojas oficiais, mas até mesmo a App Store e a Play Store podem conter vírus. Apesar do iOS ser mais seguro que o Android graças à política da Apple que impede a instalação de aplicativos de fontes externas, ainda existem aplicativos maliciosos na App Store. A principal ameaça flagrada em ambas as lojas são adwares, programas maliciosos que exibem anúncios em excesso sem a permissão do usuário.
Para diminuir as chances de baixar aplicativos infectados, é preciso prestar atenção em alguns pontos: