A principal maneira de prevenir o rotavírus é a imunização com a vacina para rotavírus humano. O esquema de vacinação é de duas doses exclusivamente por via oral, sendo a primeira aos 2 meses e a segunda aos 4 meses de idade com intervalo mínimo de 30 dias entre as doses, conforme o Ministério da Saúde.
No entanto, a vacina é contraindicada nos seguintes casos: imunodeficiência, uso de imunossupressores ou quimioterápicos, história de doença gastrointestinal crônica, má-formação congênita do trato digestivo não corrigida, história prévia de invaginação intestinal ou história de hipersensibilidade a qualquer componente da vacina.
Ainda de acordo com o Ministério da Saúde, outras ações de prevenção incluem práticas de higiene e consumo adequado de alimentos, como:
Lavar sempre as mãos antes e depois de utilizar o banheiro, trocar fraldas, manipular/preparar os alimentos, amamentar e/ou tocar em animais;
Lavar e desinfetar as superfícies, utensílios e equipamentos usados na preparação de alimentos;
Proteger os alimentos e as áreas da cozinha contra insetos, animais de estimação e outros animais (guardar os alimentos em recipientes fechados);
Guardar a água tratada em vasilhas limpas e de boca estreita para evitar a recontaminação;
Não utilizar água de riachos, rios, cacimbas ou poços contaminados;
Ensacar e manter a tampa do lixo sempre fechada;
Usar sempre a privada, mas se isso não for possível, enterrar as fezes sempre longe dos cursos de água;
Manter o aleitamento materno (aumenta a resistência das crianças contra as diarreias), evitando o desmame precoce.