O rotavírus é considerado altamente contagioso, mas pode ser evitado. Uma importante maneira de prevenção é administração da vacina para rotavírus humano em crianças menores de seis meses. O esquema de vacinação é de duas doses dadas via oral, sendo a primeira aos dois meses e a segunda, aos quatro meses. Entre as doses, é recomendado que seja feito um intervalo mínimo de 30 dias.
A vacina, no entanto, é contraindicada em casos específicos, como imunodeficiência, uso de imunossupressores ou remédios quimioterápicos, má-formação congênita ou hipersensibilidade a qualquer componente da vacina, entre outros. Em caso de dúvida, é importante buscar orientação médica.
A principal forma de contágio é pelo contato, principalmente por mãos ou objetos infectados com o vírus, que se acumula nas fezes durante o ciclo da doença. Há ainda a possibilidade de contágio por meio de brinquedos, alimentos e água contaminada.