Em 13 de Maio de 1981, o Papa João Paulo II sofreu uma tentativa de assassinato, numa quarta-feira igual a esta, em plena Praça de São Pedro, no Vaticano. O Papa foi atingido duas vezes por arma de fogo e ficou gravemente O Papa sofreu perda de grande quantidade de sangue e teve que passar por delicada cirurgia.
Quando ele entrou na Praça de São Pedro para discursar para uma audiência em 13 de maio de 1981, João Paulo II foi baleado e gravemente ferido por Mehmet Ali Ağca, um expert atirador turco que era membro do grupo militante fascista Lobos Cinzentos.
O assassino usou uma pistola semi-automática 9 mm Browning, atingindo-o no abdômen e perfurando seu cólon e intestino delgado várias vezes . João Paulo II foi levado às pressas para a Policlínica Gemelli.
No caminho para o hospital, ele perdeu a consciência. Ele passou por cinco horas de cirurgia para tratar sua perda maciça de sangue e feridas abdominais. Os cirurgiões realizaram uma colostomia, reencaminhando temporariamente a parte superior do intestino grosso para deixar a parte danificada inferior curar.[Quando ele ganhou rapidamente a consciência antes de ser operado, ele instruiu os médicos para não remover o seu Escapulário de Nossa Senhora do Carmo durante a operação. O Papa afirmou que Nossa Senhora de Fátima ajudou a mantê-lo vivo durante todo o seu calvário.
O local exato do atentando foi marcado no chão da Praça de São Pedro. Em uma rocha, estão o brasão de armas de João Paulo II e a data do atentado, em numerais romanos.
O criminoso que atentou contra a vida de João Paulo II foi Mehmet Ali Ağca, um terrorista turco. Ağca foi detido imediatamente e posteriormente condenado à prisão perpétua por um tribunal italiano. Mais tarde, o Papa perdoou o terrorista pela tentativa de homicídio. Ele também recebeu o perdão do então presidente da Itália, Carlo Azeglio Ciampi, a pedido do religioso e foi deportado para a Turquia em junho de 2000.
Posteriormente, o Papa João Paulo II escreveu, no seu livro Memória e Identidade, Weidenfeld & Nicolson, 2005, p.184:
Eu poderia esquecer que o evento (Tentativa de assassinato de Ali Agca) na Praça de São Pedro teve lugar no dia e na hora em que a primeira aparição da Mãe de Cristo aos pastorinhos estava sendo lembrada por 60 anos em Fátima, Portugal? Mas em tudo o que aconteceu comigo naquele mesmo dia, senti que a proteção extraordinária maternal e cuidadosa, acabou por ser mais forte do que a bala mortal.”